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Bioinformatik, Biologe, Biochemiker als Wissenschaftlicher Mitarbeiter - Molekulare Mikrobiologie und Genomanalyse

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STELLENAUSSCHREIBUNG
Das Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR) ist das nationale Institut, das auf der Grundlage international anerkannter wissenschaftlicher Bewertungskriterien Gutachten und Stellungnah­men zu Fragen der Lebensmittel-, Futtermittel- und Chemikaliensicherheit und des gesundheit­lichen Verbraucherschutzes erstellt. In diesen Bereichen berät es die Bundesregierung sowie andere Institutionen und Interessengruppen. Das BfR betreibt eigene Forschung zu Themen, die in engem Zusammenhang mit seinen Bewertungsaufgaben stehen. Es ist eine rechtsfähige Anstalt im Geschäftsbereich des Bundesministeriums für Ernährung und Landwirtschaft (BMEL).
In der Abteilung Biologische Sicherheit des BfR ist in der Fachgruppe „Molekulare Mikrobi ologie und Genomanalyse“ ab sofort unbefristet folgende Stelle zu besetzen:

Wissenschaftliche/r Mitarbeiterin / Mitarbeiter

- Entgeltgruppe 14 TVöD -
Kennziffer: 1473/2016
Teilzeitbeschäftigung ist möglich.
Aufgaben:
  • Eigenverantwortlicher Aufbau und Verifizierung von Abläufen zur Gesamtgenomse quenztypisierung von bakteriellen Erregern, insbesondere Enteritiserreger
  • Entwicklung von automatisierten Datenanalysepipelines für Genomsequenzen bakterieller Erreger (Assemblierung, Mapping, Annotieren, Alignments, wgMLST, vergleichende Analysen) unter Berücksichtigung verschiedener Next-Generation Sequenzierungstechnologien
  • Entwicklung und Einrichtung von Softwaretools für die Identifizierung von spezifischen Erregersequenzen, z.B. hinsichtlich ihrer Virulenz, Resistenz und Phylogenie
  • Aufbau und Verwaltung einer Genomsequenzdatenbank und Auswertung von Ge nomsequenzdaten
  • Qualitative und quantitative Auswertung von Metagenomsequenzen
  • Interne und externe Beratung von Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern hinsicht lich der Genomdatenauswertung sowie Durchführung von Anwenderworkshops
  • Beteiligung an und Einwerbung von Drittmittelprojekten, sowie aktiver wissenschaftlicher Austausch mit nationalen und internationalen Kooperationspartnern
  • Abfassen von wissenschaftlichen Publikationen und Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse
  • Betreuung von Praktikantinnen/Praktikanten, Studentinnen/Studenten, Doktorandin nen/Doktoranden
Anforderungen:
  • Abgeschlossenes Hochschulstudium der Bioinformatik, Biologie, Biochemie oder einer vergleichbaren Fachrichtung, Promotion erforderlich
  • Mehrjährige Erfahrung auf dem Gebiet der Gesamtgenomsequenzdatenanalyse von Bakterien und ihrer bioinformatischen Auswertung erforderlich
  • Fundierte Kenntnisse mit sequenzbasierten molekularbiologischen Typisierungsmethoden zur Untersuchung bakterieller Evolution (z.B. MLST) notwendig
  • Fundierte Kenntnisse von NGS-Datenanalyseprogrammen wie BioNumerics und CLCbio Genomics Workbench
  • Fundierte bioinformatische Kenntnisse von open-source Programmen für vergleichende Genomanalysen (Mapping, Alignments, Variant Calling) und phylogenetische Analysen wie BEAST, Blast, ClustalW, R, Mega, SeqAn, Galaxy sowie für die Visualisierung genomischer Daten unabdingbar
  • Gute Kenntnisse im Umgang mit Genomdatenbanksystemen
  • Beherrschung von Unix bzw. Linux und Skriptsprachen wie Python, Biopython, Shell erforderlich; Kenntnisse anderer Programmiersprachen von Vorteil
  • Einschlägige Publikationen auf dem Gebiet der bakteriellen Genomsequenzvergleiche
  • Erfahrung in Gremienarbeit auf nationaler und internationaler Ebene wünschenswert
  • Ausgeprägte Kommunikationsfähigkeit und Erfahrungen in der Anleitung von Praktikantinnen/Praktikanten, Studentinnen/Studenten, Doktorandinnen/Doktoranden und Hospitantinnen/Hospitanten
  • Sehr gute Kenntnisse der englischen Sprache in Wort und Schrift erforderlich
  • Gute EDV-Kenntnisse sowie eine gewissenhafte Arbeitsweise, Flexibilität, Teamfähigkeit und Belastbarkeit sowie die Bereitschaft zu Dienstreisen werden vorausgesetzt
Der Dienstort ist Berlin.
Nähere Auskünfte erteilen Herr PD Dr. Burkhard Malorny (Tel.: 030 18412 - 2237) und Herr PD Dr. Karsten Nöckler (Tel.: 030 18412- 2053)
Das BfR begrüßt Bewerbungen von Menschen aller Nationalitäten. Als innovative wissenschaftliche Einrichtung bietet das BfR familien freundliche Arbeitsbedingungen. Dafür wurde das BfR mit dem Zertifikat „audit berufundfamilie®“ ausgezeichnet. Das BfR gewährleistet die berufliche Gleichstellung von Frauen und Männern. An der Bewerbung von Frauen besteht daher ein besonderes Interesse.
Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung besonders berücksichtigt; von ihnen wird nur ein Mindestmaß an körperlicher Eignung verlangt.
Bewerbungsverfahren
Fühlen Sie sich angesprochen?
Dann bewerben Sie sich bitte bis zum 25. Mai 2016 über unser Online-System:
Für Fragen im Zusammenhang mit dem Bewerbungsverfahren steht Ihnen Frau Wilhelm (Tel.: 030 18412-4808) gerne zur Verfügung.
Sofern Sie sich nicht online bewerben können, verweisen wir auf den Weg der postalischen Bewerbung unter Angabe der jeweiligen Kennziffer (Bundesinstitut für Risikobewertung, Personalreferat - 11.17 -, Max-Dohrn-Str. 8-10, 10589 Berlin).
Bitte beziehen Sie sich bei Ihrer Bewerbung auf jobvector und geben Sie die folgende Referenznummer an: 1473/2016