Verflixt! Es sieht so aus, als wenn Sie einen veralteten Browser benutzen. Wir empfehlen Ihnen dringend Ihren Browser zu aktualisieren.
Weitere Informationen über Browser und Updates finden Sie hier

Doktorand/-in: Mikrobielle Bioprozessentwicklung mit Mikrokultivierung und Laborautomation

Diese Stellenanzeige ist abgelaufen. Finden Sie hier zahlreiche ähnliche Jobs.

Beschleunigte Bioprozessentwicklung durch parallelisierte Mikrokultivierung, Bioanalytik und Laborautomation
 
Im Rahmen der Bioökonomie werden durch die industrielle Biotechnologie zahlreiche Produkte durch mikrobielle Stoffumwandlung aus nachwachsenden Rohstoffen hergestellt. Neben der Herstellung von Fein- (z.B. Chiralika, Pharma-Aminosäuren, Vitamine, etc.) und Bulk-Chemikalien  (z.B. 1,3-Propan-Diol, L-Lysin, L-Glutamat, Ethanol, Succinat etc.) hat die Gewinnung homologer und heterologer Proteine eine wichtige Position in der industriellen Biotechnologie, wobei auch die Kultivierung phototropher Systeme an Bedeutung gewinnt.
 
Für die Entwicklung leistungsfähiger mikrobieller Bioprozesse stellen sich in der Regel mindestens zwei grundlegende Fragestellungen. Zum einen ist es wichtig geeignete mikrobielle Plattformorganismen auszuwählen und sie in geeigneter Form genetisch zu modifizieren. Zum anderen müssen diese Stämme bioprozesstechnisch charakterisiert und zusammen mit der genetischen Stammentwicklung iterativ optimiert werden. Diese Arbeiten geschehen zumeist in Laborbioreaktoren, um eine gute Prozesskontrolle und aussagekräftige Ergebnisse zu erhalten. Jedoch kann selbst mit 4-fach parallelen Laborbioreaktorsystemen nur ein relativ geringer Kultivierungsdurchsatz erzielt werden. Dies wird insbesondere im direkten Vergleich zur Geschwindigkeit der aktuellen molekularbiologischen Techniken deutlich, mit der eine enorme Zahl an Stammvarianten in kurzer Zeit konstruiert werden können.
 
Dieses Defizit auf der Seite der Bioprozessentwickung kann durch miniaturisierte Kultivierungssysteme ausgeglichen werden, in dem die Stämme unter Bedingungen mit guter Vergleichbarkeit zum Labor-Bioreaktormaßstab mit Volumina von ca. 1 mL im Mikroplattenformat parallelisiert kultiviert werden können. Durch die vollständige Integration in Laborroboterplattformen mit partieller Automatisierung wesentlicher Verfahrensschritte wird hier eine starke Beschleunigung in der mikrobiellen Bioprozessentwicklung erreicht.
 
Für die Fortsetzung dieser Forschungsaktivität suchen wir eine/n Doktoranden/in für eine dreijährige Promotionsarbeit. Der thematische Schwerpunkt der Arbeit wird hierbei in der Entwicklung neuer Verfahren und Methoden für die intelligente Einbindung der teilautomatisierten Kultivierungsplattform in die Bioprozessentwicklung zur Gewinnung von Wertstoffen (Proteine, natürliche/nicht-natürliche Metaboliten) liegen. Für ausgewählte Produktionsorganismen kann die gezielte Anwendung von Omics-Technologien erforderlich werden, um die Funktion des Stoffwechselnetzwerks besser zu verstehen. In der Kombination aus beschleunigter Bioprozessentwicklung und Detailanalyse des Stoffwechselsystems können damit maßgeschneiderte Prozesse schneller und effizienter entwickelt werden.
 
Die Besetzung der Stelle erfolgt im Rahmen des durch die Helmholtz-Gemeinschaft geförderten „Microbial Bioprocess Lab (MiBioLab) – Ein Helmholtz Innovation Lab“. Dieses Projekt verbindet die starke grundlagenorientierte Forschung im Bereich bioprozesstechnischer und bioanalytischer Technologien am IBG-1 mit der industriellen Anwendung. Das Ziel ist dabei die translationale Forschung, d.h. die Entwicklung und Anwendung neuer innovativer Werkzeuge für die Bioprozessentwicklung und deren bidirektionaler Transfer in die industrielle Umgebung.
 
Das Projekt ist ausgesprochen interdisziplinär und bedingt die Zusammenarbeit zwischen Ingenieuren, (Bio-)Chemikern, Molekularbiologen und der Bioinformatik. Die Finanzierung des 3-jährigen Projekts ist gegeben. Die Vergütung erfolgt mit einer 0,5 Stelle TVöD E13-1, zu der eine Zulage in Höhe von 0,25 TVöD E13-1 gewährt werden kann.

Die Stelle ist zum 01.11.2016 zu besetzen. Die vorgesehene Bewerbungsfrist endet am 29.08.2016, stellt jedoch kein festes Ausschlußkriterium dar. 
 
Informationen zum „Microbial Bioprocess Lab – Ein Helmholtz Innovation Lab“:

http://www.fz-juelich.de/SharedDocs/Pressemitteilungen/UK/DE/2016/16-05-10mibiolab.html?nn=448936
 
 
Literatur:
Rohe, P., Venkanna, D., Kleine, B. et al. Microb Cell Fact (2012) 11: 144. doi:10.1186/1475-2859-11-144
http://link.springer.com/article/10.1186/1475-2859-11-144
 
 
Unthan, S., Radek, A., Wiechert, W. et al. Microb Cell Fact (2015) 14: 32. doi:10.1186/s12934-015-0216-6
http://link.springer.com/article/10.1186/s12934-015-0216-6
 
 
Freier, L., Hemmerich, J., Schöler, K., Wiechert, W., Oldiges, M. and von Lieres, E. (2016), Framework for Kriging-based iterative experimental analysis and design: Optimization of secretory protein production in Corynebacterium glutamicum. Eng. Life Sci.. doi: 10.1002/elsc.201500171
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/elsc.201500171/abstract
 
 
Anforderungen:
Hochschulstudium in Biotechnologie, Bioingenieurwesen, Chemie, Biochemie oder vergleichbarer Disziplin mit Master/Diplom 2,0 oder besser; großes Interesse an mikrobieller Kultivierungstechnik, Bioprozessentwicklung und Stammkonstruktion, sowie die Fähigkeit in einem interdisziplinären Team zu arbeiten.
 
 

Kontaktdaten


Art des Bewerbungszugangs
Bitte senden Sie Ihre aussagekräftigte und vollständige Bewerbung entweder per Post oder elektronisch per email (bitte dann ihre Unterlagen zu einem Dokument zusammenfügen).
 
Kontakt für Bewerbungen
Prof. Marco Oldiges
Tel.: 02461/61-3951
e-mail: m.oldiges@fz-juelich.de
 
Forschungszentrum Jülich GmbH
Institut für Bio- und Geowissenschaften
IBG-1: Biotechnologie
Leo-Brandt-Str.
52425 Jülich
  http://www.fz-juelich.de/ibg/ibg-1/EN/Research/SystemsBiotechnology/bioproc/bioproc_node.html  
 
RWTH Aachen
Institut für Biotechnologie
Lehr- und Forschungsgebiet Bioprozessanalytik
Worringer Weg 3
52074 Aachen
http://www.biotec.rwth-aachen.de/index.php?page=members

Details der Stellenanzeige


Arbeitszeit
Vollzeit
Vertragslaufzeit
Befristete Anstellung
Stellentyp
Promotionsstelle
Berufserfahrung
Berufserfahrung nicht vorausgesetzt
Region
Deutschland (Nordrhein-Westfalen)
Arbeitsort
52428 Jülich
Fachgebiet
Biotechnologie, Biologie & Life Sciences, Chemie, Chemieingenieurwesen & Verfahrenstechnik
JETZT BEWERBEN