Das Institut für Angewandte Ökologie erforscht und bewertet seit mehr als 15 Jahren terrestrische und aquatische Biotope und Ökosysteme. Zentraler Forschungsschwerpunkt der 1993 gegründeten privatwirtschaftlichen Forschungseinrichtung ist ökologisches Monitoring, das in Empfehlungen für den nationalen, wie auch europäischen Naturschutz (EU-Wasserrahmenrichtlinie, Fauna-Flora-Habitat-Richtlinie) und die Raum- und Umweltplanung mündet. Das nötige Know-how gewährleisten 45 Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler sowie qualifizierte Techniker verschiedener Disziplinen (Biologie, Geographie, Geologie, Ingenieurwesen etc.) und ein seit Jahren etabliertes internationales Netzwerk von Partnerforschungseinrichtungen: Gemeinsam und übergreifend untersuchen wir komplexe ökologische Fragestellungen.

Ziel der Forschungsarbeiten am Institut für Angewandte Ökologie ist die Beschreibung natürlicher Ökosysteme sowie die Abschätzung, Bewertung und Dokumentation von Änderungen, die teils natürlich, teils durch menschliche Nutzung hervorgerufen werden. Daneben bietet das Institut Koordination, Beratung und Dienstleistung für Landes- und Bundesbehörden.

Die umfangreiche Ausstattung mit modernster Technik (benthosökologisches und ökophysiologisches Labor, Sedimentanalytik, standardisierte Probenahmegeräte, ferngesteuertes Unterwasserfahrzeug, Unterwasservideokameras, Radargeräte und automatisches Kamerasystem zur Erfassung des Vogelzugs) für den Einsatz auf hoher See, im Küstenbereich und auf Binnengewässern sowie annähernd 9.000 auf Artniveau bestimmte, in unserer Belegsammlung archivierte Individuen aus 600 Organismenarten und -familien und eine leistungsstarke Informationstechnik garantieren eine effiziente Durchführung von Forschungsvorhaben auf wissenschaftlichem Spitzenniveau.