Unsere Behörde ist in drei Fachbereiche gegliedert. Der Fachbereich Hochbau ist zuständig für zivile Baumaßnahmen des Freistaats Bayern und der Bundesrepublik Deutschland, sowie für die Baumaßnahmen der Bundeswehr im Amtsbereich. Eigens für Baumaßnahmen der Universität gibt es den Fachbereich Universitätsbau. Der dritte Fachbereich Straßenbau ist verantwortlich für Planung, Bau, Betrieb und Erhaltung der Bundes- und Staatsstraßen in den Landkreisen Augsburg, Aichach-Friedberg und Donau-Ries. Für den Betriebs- und Winterdienst sind die Straßenmeistereien in Gersthofen und Nördlingen zuständig.